不要盲目地将益生菌补充剂纳入您的日常生活中。大多数益生菌补充剂都是垃圾。标签错误和宣传不准确只是市场上大多数益生菌存在的众多问题之一。

一项研究调查了52种益生菌产品的内容，发现许多产品（尤其是补充剂）的标签不准确，细菌菌株减少或缺失，有些甚至含有潜在的病原体。

意大利对72种益生菌补充剂的研究发现，87%甚至不符合意大利关于益生元和益生菌的指导方针，微生物的数量、纯度、种类和活力存在差异。

许多补充剂都列出了双歧杆菌，但很少被检测到，而且仅以死细胞的形式存在。此外，凝结芽孢杆菌孢子有时无法存活，并且一些补充剂含有蜡状芽孢杆菌等潜在有害物种。

其他研究也发现益生菌补充剂中含有病原体，而不是所声称的益生菌菌株。例如，在原本应该含有安全益生菌菌株（如双歧杆菌和乳酸杆菌）的产品中，却含有微胞藻、葡萄球菌、肠球菌和芽孢杆菌。